企业所得税方面规定，《企业所得税法实施条例》第二十五条要求，企业发生非货币性资产交换，以及将货物、财产、劳务用于捐赠、偿债、赞助、集资、广告、样品、职工福利或者利润分配等用途的，应当视同销售货物、转让财产或者提供劳务，但国务院财政、税务主管部门另有规定的除外。
另外，国家税务总局《关于企业处置资产所得税处理问题的通知》（国税函〔2008〕828号）规定，企业将资产移送他人的下列情形，因资产所得权属已发生改变而不属于内部处置资产，应按规定视同销售来确定收入。即：1.用于市场推广或销售；2.用于交际应酬；3.用于职工奖励或福利；4.用于股息分配；5.用于对外捐赠；6.其他改变资产所有权属的用途。
上述文件并未将自产货物用于自建厂房列入视同销售货物范围，所以在企业所得税方面不作视同销售货物处理。
增值税方面规定，《增值税暂行条例实施细则》第四条规定，单位或个体经营者将自产或委托加工的货物用于非增值税应税项目的行为，视同销售货物。所称非增值税应税项目，是指提供非增值税应税劳务、转让无形资产、销售不动产和不动产在建工程。所称不动产是指不能移动或者移动后会引起性质、形状改变的财产，包括建筑物、构筑物和其他土地附着物。
纳税人新建、改建、扩建、修缮、装饰不动产，均属于不动产在建工程，因此将自产货物用于自建厂房的，在增值税方面应作视同销售货物处理。